難易度に関してはヒミツ面や一部の面が若干難しいことを除けば、さほど高くないと言える。
この難しさにはアクション自体の難しさと、謎解きの難しさの2つがある。
前者では俗に言うパチンコと激流、それとフーセン割りが、後者ではヨッシーのフルーツだいさくせん、めいきゅうホテル・デルフィーノ、あかコインとフワフワわたげあたりが3大難関であろう。
まぁそれでも総合的な難易度はシリーズ中最低であろう(2と64は未経験だが)。
というわけでマリサンの醍醐味は、様々なアクションを駆使することと、発見する喜びという2点であろう。