機動戦士ガンダムSEED DESTINY（9ステージ）
| ステージ1 戦いを呼ぶもの | |
| 敵ユニット | 前編＞ ガイアガンダム アビスガンダム カオスガンダム 後編＞ ガイアガンダム アビスガンダム カオスガンダム ダークダガーL ダガーL（ドッペルホルン） エグザス ガーティー・ルー |
| 味方ユニット | 前編＞ ザクウォーリア 後編＞ フォースインパルス ルナマリア専用ザクウォーリア レイ専用ブレイズザクファントム ミネルバ |
| 特殊イベント | 前編＞ 出撃！インパルス アスランとガイアで戦闘を繰り返していると発生 |
| 備考 | 前編＞3機の逃げる敵ガンダムを攻撃。相手からは攻撃してこないので安心。 後編＞ |
| ステージ2 世界の終わる時 | |
| 敵ユニット | ジンハイニューバ2型 ダークダガーL（ドッペルホルン） ガイアガンダム カオスガンダム アビスガンダム ガーティー・ルー |
| 味方ユニット | フォースインパルス ルナマリア専用ザクウォーリア レイ専用ブレイズザクファントム ミネルバ ブレイズザクウォーリア ガナーザクウォーリア イザーク専用スラッシュザクファントム |
| 特殊イベント | |
| 備考 | 8ターンの間、メテオブレイカーを守る。 当然ながら増援が来るので黄色軍をなるべく早く倒していきたい。 |
| ステージ3 ローエングリンを討て！ | |
| 敵ユニット | ダガーL（ジェットストライカー） トーチカ ウィンダム（ジェットストライカー） ゲルズゲー |
| 味方ユニット | セイバーガンダム レイ専用ブレイズザクファントム ルナマリア専用ガナーザクウォーリア ミネルバ デズモンド ビートリー級中型地上戦艦 ガズウート インパルスガンダム |
| 特殊イベント | |
| 備考 | ３ターン目に上下に増援。 ４ターン目にも上下に増援。 更にその後も毎ターンのように上下に増援。 シンがマップを抜ければ勝利だが、迷路が面倒なので敵を全滅させてもいい。 なお、シンの方のマップには敵は出現しない。 |
| ステージ4 蒼天の剣 | |
| 敵ユニット | ムラサメ Ｍ１アストレイ（シュライク） タケミカズチ オーブ軍イージス艦 ガイアガンダム カオスガンダム アビスガンダム ウィンダム（ジェットストライカー） Ｊ．Ｐ．ジョーンズ フリーダムガンダム バルトフェルド専用ムラサメ アークエンジェル（ＣＥ７３） |
| 味方ユニット | ブラストインパルス セイバーガンダム ハイネ専用グフイグナイテッド レイ専用ブレイズザクファントム ルナマリア専用ガナーザクウォーリア |
| 特殊イベント | |
| 備考 | タケミカズチのＨＰをある程度減らすとフリーダム＆アークエンジェル出現。 同時にカオス、アビス、ガイアなどの赤軍の増援も出現。 フリーダムを倒せば黄色軍は撤退。 |
| ステージ5 明けない夜 | |
| 敵ユニット | デストロイガンダム カオスガンダム ネオ専用ウィンダム ウィンダム（ジェットストライカー） |
| 味方ユニット | フォースインパルスガンダム ミネルバ フリーダムガンダム アークエンジェル ストライクルージュ ムラサメ |
| 特殊イベント | 明けない夜 シンで2回攻撃をすれば発生（フリーダム生存） |
| 備考 | 敵を倒していくとウィンダムの増援。 デストロイのMAP攻撃、射程などが脅威。 増援も多く、やりづらい。 |
| ステージ6 新しき旗 | |
| 敵ユニット | デストロイガンダム フォビドゥンヴォーテクス ザムザザー ウィンダム ユークリッド ランチャーダガー 地球連合軍イージス艦 |
| 味方ユニット | デスティニーガンダム レジェンドガンダム フォースインパルスガンダム ミネルバ 地球連合軍イージス艦 パビ |
| 特殊イベント | |
| 備考 | 5機のデストロイを含む敵軍をそのまま撃破していく。 このステージは敵増援はなし。 |
| ステージ7 自由と正義と | |
| 敵ユニット | デスティニーガンダム レジェンドガンダム パビ アッシュ グーン グフイグナイテッド ポズゴロフ級戦艦 地球連合軍イージス艦 ミネルバ |
| 味方ユニット | アカツキ（オオワシ装備） ムラサメ M1アストレイ アークエンジェル（CE73） ストライクフリーダムガンダム インフィニットジャスティスガンダム |
| 特殊イベント | |
| 備考 | 数ターン後にミネルバ＆敵増援出現。 同時にアークエンジェルが増援で出現。 更にターン経過で上空に敵援軍、同時にキラが出現。 更にターン経過で上空に敵援軍、同時にアスラン出撃。 更にターン経過でドムトルーパーが援軍で出現、同時に敵増援も出現。 |
| ステージ8 変革の序曲 | |
| 敵ユニット | ウィンダム ザムザザー ネルソン ドレイク ゲルズゲー MS搭載型アガメムノン級宇宙母艦 ユークリッド ランチャーダガー デストロイガンダム シャトル |
| 味方ユニット | ディアッカ専用ブレイズザクファントム イザーク専用グフイグナイテッド ガナーザクウォーリア デスティニーガンダム レジェンドガンダム ブラストインパルスガンダム ミネルバ |
| 特殊イベント | |
| 備考 | 2ターン目に月面に増援。 3ターン目には月面にデストロイが増援。 更にターン経過でジブリールが月面に出現、これを倒すことが勝利条件になる。 |
| ステージ9 最後の力 | |
| 敵ユニット | ミネルバ フォースインパルスガンダム グフイグナイテッド ゲイツR スラッシュザクウォーリア ブレイズザクウォーリア ガナーザクウォーリア ナスカ ゴンドワナ ローラシア スラッシュザクファントム ブレイズザクファントム ガナーザクファントム デスティニーガンダム レジェンドガンダム |
| 味方ユニット | ストライクフリーダム（ミーティア） インフィニットジャスティス（ミーティア） エターナル アークエンジェル（CE73） アカツキ（シラヌイ装備） ドムトルーパー クサナギ ディアッカ専用ブレイズザクファントム イザーク専用グフイグナイテッド |
| 特殊イベント | 在るべき正しい世界へ レジェンドのHPが減った状態でキラと戦闘で発生 |
| 備考 | ミネルバを倒すとイザークたちが援軍で出現。 同時にマップが上に広がり、シンたちも出現。 勝利条件が一旦キラの5ターン以内のメサイヤ到達となる。 それを満たした後、残りの敵を全滅させれば勝利。 |
| シリーズクリアで入手できるパイロット |
| シン・アスカ レイ・ザ・バレル ルナマリア・ホーク メイリン・ホーク タリア・グラディス ハイネ・ヴェステンフルス |