ストーリー

ストーリーガイドです。

場所	対戦相手	内容
時計塔広場美術館カード屋	一般デュエリスト本田磯野バクラデュエルロボ	ゲーム開始後まずは広場を歩き回り、遊戯や梶木といったデュエリストにＲボタンで話しかける。全員に話しかけると９時になりゲームスタート。最初はゲームになれるために一般人を相手にしていこう。すごい弱いので楽勝なはず。加えて、この時点で行ける場所をまわっておこう。カード屋でカードを買ったり、美術館でバクラと戦ったり、海馬コーポレーションでロボの相手をしたり。ＤＣを簡単に稼ぎたければ自宅前の本田がお勧め。ドミノを稼ぐならデュエルロボあたりかな。
墓地	ゴースト骨塚	デッキ強化がすんだらストーリーを進めよう。まずは広場北東の墓地にいる骨塚から。手下を倒してから対戦する。弱いので負けることはないはず。勝てば「ゴースト王・パンプキング」が手に入る。また、コイツとは序盤から何度も戦えるのでＤＣ上げにピッタリ。
広場北	エスパー絽場	広場真ん中から北の路地に行くと絽場の弟がいる。二人の弟を倒すと本物が登場。デュエルしよう。サイコショッカーは強いがそこまで持っていかせなければ余裕のはず。勝てばサイコを入手できる。
広場東	ダイナソー竜崎	ＤＣが増え、デュエリストレベルが８０以上になると竜崎と戦える。相手は土属性がメイン。風属性モンスターがいれば簡単な相手。勝てばソードドラゴンが手に入る。
公園	一般デュエリスト	竜崎に勝つとＭＡＰに新たな場所、公園が出現する。そこには羽蛾がいるが、この時点で倒してしまうと遊戯を戦えなくなるので後に残そう。羽蛾以外の雑魚を片付けておく。
墓地	レアハンター	広場に戻るとグールズのウワサが・・・。墓地を追い出された骨塚から話を聞き、敵をうちにいこう。倒したら、広場真ん中から下に行った場所の一般人から話を聞いておく。これでカード屋にパンドラが出現する。
カード屋	パンドラ	広場で話を聞いてから訪れるとパンドラとのデュエルとなる。デッキが順調に強化されていれば問題のない相手。倒せばブラックマジシャンが手に入る。
双六の店	遊戯	パンドラを倒してから双六の店へ行くと遊戯がいる。この時しか戦うチャンスがないのでぜひ戦っておこう。なお、ここまでに羽蛾を倒してしまっていると遊戯ではなくナムが出現する。
公園	羽蛾	遊戯を倒したら公園にいる羽蛾を掃除にいく。森フィールドで少しやっかいだが、苦労しないで倒せるはず。勝利後、インセクト女王をゲット。
双六の店	なし	羽蛾を倒したら双六の店へ。そこにはナムが現れている。彼に話すと新たに橋下とビルにいけるようになる。
橋下	人形	マップに入ると海馬がいるがここでは戦えない。右上に行くと人形が出現、対戦する。オシリスを持っているので注意。呼ばれるとまず勝てない。分裂モンスターが多く、結構手強い相手かも。倒せばリバイブルスライムを入手。
ビル	孔雀舞	ビルの入り口で舞がいるので対戦してみる。その後、ビル内の城の内に話しかけておく。さらに雑魚と戦っておこう。
水族館	城の内梶木	新たに出現している水族館にはいる。中では梶木と城の内が対戦している。まず館内の雑魚と戦ってから、城の内、梶木とデュエルしよう。梶木は海フィールドを利用して力押しでくるので手強いかも。
双六の店	なし	ここまででパズルカードが６枚揃ったはず。その状態で双六の店にくと、グールズが来襲する。連れ去られた城の内と杏子を探し、町を探す事に。
墓地広場北水族館橋下美術館	グールズ	町の各地にグールズが出現してるので全部倒しておこう。５人倒したら公園へ。
公園	キース	公園の羽蛾のいる場所にキースが出現。羽蛾がやられた後に対戦する。キースを倒せばリボルバードラゴンが手に入る。
双六の店海馬コーポレーション	なし	キースを倒した後、双六の店で遊戯と合流する。二人で海馬コーポレーションへ行き、磯野から話を聞く。その後、モクバを追ってビルへ。
ビル	光の仮面闇の仮面	モクバを助けにビルに向かう。そこで光の仮面か闇の仮面のどちらかと対戦する。光だと勝てばデスガ―ディウスが、闇だとマスクドヘルレイザーが手に入る。欲しいカードの相手を選ぼう。モクバを助けたら美術館へ。
美術館	なし	海馬から話を聞くため美術館へ。あっさりとふ頭に城の内がいることがわかる。
ふ頭	キース城の内	城の内の前にまたも道をふさぐキースが。もう一度倒しておこう。続いて、マリクに洗脳された城の内とのデュエルとなる。直接攻撃魔法などがあるので気をつける。また、ふとうの最初のマップの左右の建物へは入れる。中にはデュエリストが隠れているので対戦しよう。
水族館	マグナム	城の内を助けたら水族館へ行って見よう。マグナムと舞がいる。成り行きでマグナムと戦うことになる。彼とはここでしか戦えない。
海馬コーポレーション	モクバ	美術館へ行く前に海馬コーポレーションの前でモクバと戦える。モクバとはこのタイミングでしか戦えないので注意。
美術館	イシズ海馬	入れるようになった美術館へ向かう。中ではイシズが待っている。まずはイシズを倒す事に。オベリスクを使ってくるので速攻で倒そう。イシズを倒したら続いて海馬が登場。今度は彼を倒すことに。ブルーアイズやアルティメットを呼ばれないように注意。倒せばイシズからオベリスクの巨神兵が貰える。ついに神のカードを手にできる。
双六の店	なし	神のカードを手に入れたら双六の店へ。いよいよ決勝へ向けて出発する。８人のデュエリストと共に飛行船へ乗り込む
飛行船	リシド	決勝が始まる。自分の試合は２戦目。相手はリシドになる。セルケトがやっかいなので気をつけよう。勝てば闇マリクが出現する。
アルカトラズ	闇遊戯	残った４人のデュエリストでアルカトラズへ。まずは自分と闇遊戯が対戦することになる。オシリスを含め、手強いかもしれないが勝てるはず。見事倒せば、オシリスの天空竜をゲットできる。
各地	骨塚竜崎羽蛾梶木キース	すぐに闇マリクとの決戦になってもよいが、一旦戻ってセーブなどをしておこう。また、左の５人のデュエリストとは戦えるのでレベルが足りなければあげておこう。キースはふ頭の右建物に隠れている。デッキ強化が済んだら決戦へ。
アルカトラズ	闇マリク	最後に闇マリクと決戦。さすがに強力なモンスターが揃っている。ハーピーの羽根箒も多いので罠も壊されやすい。ラーを呼ばれる前になんとかケリをつけたいところ。イグザリオンの直接ダメージにも要注意。勝利できればエンディングへ。なお、エンディング後にセーブなどはありません。よってラーの翼神竜は使えません・・・・