問題
もともとログインしているユーザーのみに有効になるべきものであっても「スタートアップアイテムの復元」の機能によって復元されショートカットが、全ユーザーに対して有効なものとして復元されている

原因
ショートカットに関する復元情報を取得する際に、無効にされているかされていないかの情報しか取得していなかったためで「すべてのユーザーに対して有効」か「現在のユーザーのみに対して有効」かという情報を持っていなかったためです。

解決方法
この問題を解決するには現在公開している最新版をご使用ください
このバージョン以降のものでは、内部ログのデータバージョンをVer.2としていくつかの改良を行っています。